Veja a diferença entre as funções de Cancelamento e Estorno na rotina 1316:

• Cancelamento >> cancelará a NF de devolução gerada pelas rotinas 1303, 1346, 1360, 1344 e 1332, dentro do prazo legal de 24 horas (caso sejam aprovadas na Sefaz, com o campo Situação NFe = 100) ou após as 24 horas, caso não tenham sido aprovadas. E realizam saída de estoque e financeiro e não geram saída de nota fiscal,
  
  
• Estorno >> operação realizada quando o prazo legal de 24 horas não pode ser atendido quanto ao cancelamento da devolução da mercadoria. A rotina 1316 emitirá uma NF (remessa, que não baixará estoque) para informar à Sefaz o pedido de estorno da devolução e realizará internamente a saída de estoque e ajuste financeiro, funções semelhantes ao cancelamento.

Veja a seguir um exemplo para melhor compreensão.

Exemplo

Uma mercadoria com venda estadual onde o cliente não aceitou a mercadoria e não emitiu nota, a empresa precisa emiti-la. Ocasionalmente, essa devolução foi gerada com algum erro e uma nova NF de devolução precisa ser emitida. 

Como o prazo de 24 horas já passou, por regimento legal não é possível cancelar a NF de devolução gerada pelas rotinas 1303, 1346, 1360, 1344 e 1332. Entretanto, consulte a sua contabilidade sobre a legislação vigente do seu estado para cancelamento extemporâneo ou estorno de nota fiscal, pois alguns estados não permitem esses processos.