Linha Protheus:

1. A rotina de acertos fiscais deverá ser utilizada apenas para a conferências dos valores. Em caso de operações que necessitem de correção se deve adotar o procedimento estabelecido no RICMS do respectivo Estado.
2. É importante que a informação do cadastro de Tipos de Entrada e Saída esteja coerente com a mercadoria ou serviços do documento fiscal bem como a operação que será executada.

Linha Datasul:

O CST do ICMS para os documentos de entrada é informado no momento de efetuar a entrada do documento no módulo de Recebimento através do programa: Manutenção de Documentos (RE1001) na digitação/manutenção de itens (RE1001B2), pasta "Impostos".

Caso não informar a CST no momento da entrada do documento fiscal no Recebimento, a mesma será carregada na rotina de integração.

A correção da CST para os documentos fiscais de entrada não é possível efetuar diretamente no módulo de obrigações fiscais. Para efetuar a correção é necessário  efetuar a desatualização do documento fiscal no módulo de Recebimento para o módulo de obrigações fiscais, descontabilizar no Recebimento (caso houver alteração de valores), efetuar a correção das informações e atualizar para o módulo de obrigações fiscais e contabilizar novamente o período (caso tenha descontabilizado).

A busca do CST - Código de Situação Tributária (CST) para as demais operações do Faturamento para ICMS, IPI, PIS e COFINS .

Com relação ao código de tributação é possível alterar diretamente no módulo de Obrigações Fiscais sem a necessidade de desatualizar o Recebimento.  Para efetuar a alteração acessar o módulo de Obrigações Fiscais no programa: Manutenção de Documentos Fiscais (OF0305), Manutenção dos itens do documento fiscal, revisando e informando os valores e códigos de tributação corretos.

Lembrando que a tributação do ICMS para o Faturamento e Recebimento é definida entre a combinação da tributação do IPI no cadastro da Natureza de Operação (CD0606) x Atualização itens Faturamento (CD0903). 

IMPORTANTE: Notas fiscais já autorizadas pela SEFAZ com alíquota incorreta não poderão ser alteradas, buscar orientação em sua unidade de federação em como proceder nessa situação.

Após a correção efetuar uma nova extração de dados para o módulo Configurador Layout Fiscal e gerar novamente o arquivo EFD ICMS/IPI, retificando os períodos incorretos, caso necessário.

Linha Logix:

A verificação identifica qual foi a situação tributária utilizada (CST) para apuração do ICMS  e se está de acordo com as informações preenchidas no documento. No registro C100 do SPED ICMS IPI é possível auferir o número do documento para checar posteriormente no sistema de fato como foi tributado o ICMS utilizar a 1008 para notas de saídas e 1007 para notas de entrada.

Para o caso específico do CST ICMS 60, este é o CST 60 utilizado para operações com ICMS cobrado anteriormente por substituição tributária e portanto,  não pode haver ICMS incidente na nota fiscal. Se existir é necessário excluir os valores de base de cálculo do ICMS, alíquota do ICMS, valor do ICMS e também os campos de base de cálculo ICMS ST, alíquota do ICMS ST, valor do ICMS ST. As notas podem ser acessadas e editadas via rotinas  1008(saídas) /1007 (entradas), após corrigir os campos  %ICMS, Vl. ICMS, Base ICMS para zero, salvar as alterações e  posteriormente deve ser executado a opção de "Gerar Livro Fiscal" para então atualizar as informações no livro fiscal.

*Lembrando que o CST ICMS 60 é para os contribuintes substituídos  portanto a nota não terá ICMS incidente sobre a operação, mas deverá levar o valor de ICMS ST informativo, para parametrizar o ICMS ST informativo segue a parametrização no link da base de conhecimento ao final.

Se os valores de ICMS estiverem corretos então deve-se alterar o CST ICMS, pois se existe a tributação de ICMS o código correto de CST ICMS a se usar provavelmente não será o 60.

Lembrando que a nota fiscal já emitida e autorizada pela SEFAZ, não permite ajustes, caso for necessário verificar junto a Unidade de Federação do estabelecimento emissor da mesma a correção. 

Para corrigir as próximas notas emitidas, verificar a tributação de ICMS nas figuras tributárias da rotina 514 e corrigir os valores de alíquotas aplicados, para tal processo segue a base de conhecimento:

https://centraldeatendimento.totvs.com/hc/pt-br/articles/4429790533527-WINT-Qual-a-valida%C3%A7%C3%A3o-da-flag-Calcular-ICMS-Situa%C3%A7%C3%A3o-Tribut%C3%A1ria-60-na-rotina-514