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O Grande diferencial no processo de configuração do TSS 3.0 está em relação ao volume de configurações existentes no produto, em especial para configuração dos serviços(JOBS) de processamento. Como no modelo 3.0 o processamento é realizado por demanda sendo necessário um único JOB para processamento de qualquer tipo de documento, não existe mais as configurações de Jobs específicos por documento, assim como parâmetros de Range de entidades e rotinas específicas(assinatura, transmissão etc...).
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