Na administração do TOTVS Fluig Plataforma é possível criar novas empresas, definir usuários administradores, personalizar as configurações de empresas, dentre outras possibilidades. Além disso, o painel de Administrador inclui configurações relacionadas ao ambiente e infraestrutura como servidor de e-mail, servidor de licenças, volume de dados, URL de acesso e autenticação.